整合生物学实验室依托浙江大学药物生物技术研究所、浙江大学遗传学研究所，从事计算与实验相结合的研究与工作。实验室建有分子生物学实验室、细胞房、生物样本库、计算服务器机房，自有设施与研究所公用设施互补，形成了完善的临床样本实验研究条件和强大的多组学数据协同分析能力。

实验室自有和研究所共享的实验设施包括H-7650型透射电子显微镜镜、激光共聚焦扫描显微镜、双光子显微镜、倒置荧光显微镜、荧光生物显微镜、系列荧光及化学发光成像系统、单四极杆液相色谱质谱联用仪、自动液相制备系统、快速制备色谱仪、基因克隆挑选仪、DNA测序仪、流式细胞仪、AKTA自动蛋白分离纯化系统、多功能酶标仪、seahorse XF96线粒体能量分析仪、实时荧光定量PCR仪、超微量分光光度计、Gel Logic 212 PRO凝胶成像分析系统、96孔板摇床、96孔板离心机、超速离心机、冷冻台式高速大容量离心机、小型冷冻台式离心机、小型台式离心机、二氧化碳培养箱、生物工作洁净台、生化培养箱、超净工作台、冷冻干燥机（6L）、电热恒温鼓风干燥箱、冰冻切片机、超纯水系统、高压灭菌器、-80°C超低温冰箱、2~8°C医用药品冷藏箱、-30°C医用低温冰箱、-25°C医用低温保存箱等一批先进设备。

实验室的计算分析设施包括45台计算服务器，全部接入计算平台局域网，包括2个高性能胖节点（768G内存，10TB固态硬盘阵列）、5个互联网服务专用节点、2个共享网络储存节点（50TB冗余阵列），5个测试专用节点。计算服务器运行于RHEL7.1系统，通过LDAP目录服务实现资源和权限的统一管理，通过HTCondor进行集群计算任务调度。集群系统提供常用的数据库服务、基于J2EE和JSF框架的互联网服务部署环境、常用统计和作图软件、分子模拟软件。实验室建立并维护了高质量的基因组、外显子组、转录组、蛋白组、表观遗传组数据分析标准流程，可提供对外服务。计算平台通过4路光纤聚合直连校区主干交换机，提供充足的数据传输带宽。