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主要成果

药物机制数据库系统

现有的药物或干预手段通过哪些靶标和生物途径来影响疾病的分子生理,产生治疗作用,或是因为影响了哪些靶标和生物途径造成副作用和特定的代谢动力学特征,这些知识和数据是分析多成分多靶标药物作用机制的基础。


整合生物学实验室与合作团队一起建立药物治疗作用靶标数据库 (TTD,Nucleic Acids Research,30:412)组合药物数据库 (DCDB,Bioinformatics,26:587)药物代谢动力学相关蛋白数据库 (ADME-AP, Bioinformatics,18:1699)中药信息资源数据库 (TCM-ID,British Journal of Pharmacology,149:1092),药物副作用靶标数据库 (DART,Drug Safety,26:685)。其中组合药物数据库由本实验室负责日常维护,其它数据库由合作团队维护。这些数据库的最新版收录了17,816个已批准或试验中的药物、1,363个已批准或试验中的组合药物、1,197个中药方剂、1,102个草药、12,117个草药化合物、2,025个已批准或试验中的药物靶标, 321个代谢动力学相关蛋白,236个副作用靶标,140个治疗效用分类和187个副作用分类,提供了小分子、蛋白质、分子相互作用、生物途径、生理表型、干预响应等多个层级的数据间的关联。


整合生物学实验室与合作团队一起,在收集整理数据的同时完成了对数据结构的范式化和对内容的术语化,形成了一套体系完整的可计算的药物作用机理数据资源,为研究基于多基因协同效应的疾病治疗方法完成了必须的准备,也成为当前受到广泛关注的药物系统生物学和网络药理学的一部分奠基性工作。这一数据资源体系已被广泛应用于药物相似性网络分析、疾病相似性网络分析、药物组合协同效应分析、药物重定位(老药新用)研究。



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