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基因集功能关联分析:依据功能关联网络解析组学变化的整体生物学意义

国家自然科学基金 面上项目 31571356

申请人提出了“匀质功能关联网络”的概念,以及基于这类网络分析组学变化的整体 生物学意义的方法:“基因集功能关联分析(GSLA)”。在与实验结合的研究中,发现GS LA具有独特的,能够依据“现在观察到的组学变化”解析“将要发生的整体功能改变”的 能力。GSLA发现了一些其它方法无法发现的生物学规律,例如,低出生体重增加成年慢性 疾病风险的长期分子机制,干细胞治疗暴发性肝衰竭的生物途径机制。这些发现都得到了 实验验证。但是,当前的GSLA仍有一定局限:一,仅能通过组学变化预期哪些生物途径或 生理过程将受到影响,但不能判断影响的方向(激活/抑制);二,缺乏具有广泛代表性 的测试案例集,来系统比较GSLA和其它方法的解析组学变化整体生物学意义的能力。本项 目将从这两个方面进一步发展GSLA,建立经过严格检验的实用工具,并在具体的分析应用 中(优化体外诱导干细胞定向分化为肝实质细胞的方法),检验和改进其分析能力。